일본연구소에서는 일본과 관련된 인문학·사회과학 분야의 연구를 지원함으로써 종합적이고 체계적인 일본연구의 토대를 확립하고, 인천대학교의 전문적인 일본연구 역량의 제고에 기여하는 한편, 국내외 일본 관련 연구자들과의 공동연구와 학술교류를 뒷받침하기 위하여 공동연구팀이나 개인연구자를 지원합니다.

특히 공동연구는 연구책임자를 인천대학교 소속 전임교원으로 한정한 반면 공동연구원을 외부 연구자도 참여할 수 있도록 하여 학제 간 연구를 통해 다양한 주제가 발굴될 수 있도록 하고 있으며, 단독연구에 대해서는 2008년도부터 지원 대상을 인천대학교 소속 전임교원에서 연구소 소속 연구원 및 시간강사로까지 확대하여, 신진연구자에 대한 지원을 강화하였습니다.